Doğu Türkistan bayrağının anlamı: Doğu Türkistan bayrağı ay yıldızlı gök bayraktır, bayraktaki hilal İslamiyet’i, yıldız ise bölgenin sahibi olan (Uygur Özbek Kazak vs) Doğu Türkistanlıları temsil ediyor.  Gök renk (#65B7FF) özgürlüğü ve bağımsızlığı sembol ediyor. Doğu Türkistan amblemi Besmele, Hilal, Üç yıldız ve 18 çemberlerden uluşmaktadır. Üç yıldız amblemin üstünde, Doğu Türkistan topraklarında ve içinde yer alan Göktürk Kağanlığı, Uygur Kağanlığı, Karahanlılar’ı temsil eder. Çemberler ise bölgede yaşayan 18 yerel kabileyi temsil eder. 1.Pechinek; 2.Kıpçak; 3. Oğuz; 4.Basmil; 5.Qay; 6.Yabaqu; 7.Tatar; 8.Kırgız; 9.Chigil; 10.Toqsi; 11.Yaghma; 12.Oghraq; 13.Charuq; 14.Chumul; 15.Uygur; 16.Tangghut; 17.Qitan; 18.Tawghach.

Hilalin ortasındaki Bismillah yazısı Doğu Türkistanlıların inancı olan İslamiyet’e, üst taraftaki üç yıldız tarihte kurulan Göktürk, Uygur ve Karahanlılar devletine, sağ ve soldaki 18 nokta ise tarihten beri Doğu Türkistan’da yaşamış 18 Türk kavimlerin milli birliğine sembol ediliyor. Doğu Türkistan armasında devlet, millet ve inanç çok net bir şekilde bütünleşmiştir.